始發(fā)于新發(fā)地的這輪北京疫情牽動(dòng)人心。

6月26日，中國疾病預(yù)防控制中心公布“6月北京新型冠狀病毒肺炎疫情進(jìn)展”，這份疫情專報(bào)在病毒來源分析中指出，從2例男性病例和北京新發(fā)地批發(fā)市場(chǎng)環(huán)境采集的標(biāo)本中獲得的3株病毒基因分析顯示，北京本次疫情流行的新冠病毒為L基因型歐洲家系分支Ⅰ，該毒株比當(dāng)前歐洲流行同型毒株更“老”；可以排除由動(dòng)物病毒外溢傳染人，也排除今年4月前北京本地傳播毒株或武漢流行毒株導(dǎo)致本次疫情。

疫情在新發(fā)地批發(fā)市場(chǎng)的傳染模式，推測(cè)主要為人與人之間直接接觸傳播或經(jīng)物品表面污染的間接接觸傳播。

這份疫情專報(bào)對(duì)北京本輪疫情趨勢(shì)研判認(rèn)為：在北京已經(jīng)加強(qiáng)監(jiān)測(cè)和強(qiáng)力擴(kuò)大社交距離的防控措施下，疫情進(jìn)一步傳播風(fēng)險(xiǎn)低。北京疫情近期有望得到控制。

判斷為歐洲輸入依據(jù)是什么？

關(guān)鍵標(biāo)本來自哪里？

專報(bào)中說，北京本次流行的毒株比當(dāng)前歐洲流行同型毒株更“老”，這意味著什么？依據(jù)什么判斷新發(fā)地毒株為歐洲輸入來源？

6月27日，科技日?qǐng)?bào)記者采訪了中國疾病預(yù)防控制中心病毒病預(yù)防控制所黨委書記、中國疾病預(yù)防控制中心生物安全首席專家武桂珍研究員。

通過系統(tǒng)進(jìn)化樹、亞型分析和特定位點(diǎn)分析，都支持北京新發(fā)地關(guān)聯(lián)毒株屬于同一個(gè)近緣病毒亞型，位點(diǎn)6026和28881-28883變異為北京新發(fā)地毒株的標(biāo)志性變異組合。變異位點(diǎn)6026出現(xiàn)頻率特別低，該變異疑似于3月初在歐洲形成，但未見大規(guī)模傳播（也可能是未被測(cè)序），屬于非主流傳播病毒株；28881-28883位點(diǎn)變異為境外輸入型毒株的標(biāo)志性突變，首先報(bào)告于英國，隨后流行于歐美地區(qū)，在我國本土病例中罕見。“綜上所述，判斷北京新發(fā)地毒株為歐洲輸入來源。”武桂珍說。

通過對(duì)含有特異性位點(diǎn)的樣本采集時(shí)間進(jìn)行回溯，同時(shí)帶有這些特征性變異位點(diǎn)的毒株最早于2020年3月發(fā)現(xiàn)于境外輸入病例的樣本中，此后多發(fā)現(xiàn)于3月至4月期間流行的毒株，因此判斷該毒株至少在2020年3月前產(chǎn)生。因此說，新發(fā)地流行病毒，比現(xiàn)在歐洲流行病毒要“老”。

“這其中涉及好幾種可能性。”病毒有可能會(huì)在新發(fā)地批發(fā)市場(chǎng)等陰暗潮濕的環(huán)境潛伏下來，導(dǎo)致進(jìn)化速度變慢，在適宜的時(shí)機(jī)再次感染人，由感染新冠病毒的患者或陽性感染者的排泄物污染海鮮市場(chǎng)環(huán)境間接感染導(dǎo)致的暴發(fā)疫情；另外，病毒可能潛伏在進(jìn)口的冷凍食品當(dāng)中，未拆包裝的冷凍生鮮產(chǎn)品在境外被新冠病毒感染者偶然污染，在從境外到境內(nèi)的整個(gè)存儲(chǔ)、運(yùn)輸期間，病毒由于被冷凍沒有發(fā)生進(jìn)化，所以它不會(huì)發(fā)生變異。“最終我們看到的就是這些毒株更接近于流行于歐洲的老病毒。”

“精準(zhǔn)”捉元兇背后是

高科技監(jiān)測(cè)和朔源體系

“在新冠病毒的病原體鑒定和溯源中，基于新冠病毒全基因組的分子分型方法發(fā)揮了重要作用。”武桂珍說。

生物安全攸關(guān)民眾健康、社會(huì)安定和國家戰(zhàn)略安全。傳染病病原體基因組序列是事關(guān)國家生物安全的重要戰(zhàn)略資源。中國疾病預(yù)防控制中心病毒病所張勇研究員介紹，在國家科技重大專項(xiàng)的資助下，病毒病所正在牽頭在全國籌建基于病毒全基因組的病毒網(wǎng)絡(luò)化監(jiān)測(cè)和溯源技術(shù)體系，以應(yīng)對(duì)病毒溯源這個(gè)關(guān)系到國家安全的病毒病預(yù)防控制的重大問題。

當(dāng)前，隨著基因組學(xué)技術(shù)和生物信息學(xué)以及大數(shù)據(jù)管理技術(shù)的迅速發(fā)展，新一代的基因組測(cè)序技術(shù)可以對(duì)標(biāo)本中致病微生物實(shí)現(xiàn)更加詳細(xì)的分析，通過生物信息學(xué)分析和大型服務(wù)器的高速運(yùn)算對(duì)海量全基因組序列數(shù)據(jù)進(jìn)行加工整理，可以準(zhǔn)確進(jìn)行病毒的溯源，洞悉病原體進(jìn)化的過程，發(fā)現(xiàn)其毒力和致病因子、耐藥基因，從而把握病原體致病和耐藥機(jī)制，為病毒病“精準(zhǔn)防控”提供理論依據(jù)。

病原體基因組學(xué)領(lǐng)域保持著持續(xù)較快發(fā)展的態(tài)勢(shì)，各種分子技術(shù)正在被整合進(jìn)入病毒性傳染病的診斷和預(yù)防控制之中。將基因組技術(shù)與生物信息學(xué)和流行病學(xué)有機(jī)整合起來，改善了傳染病的公共衛(wèi)生監(jiān)測(cè)、研究和控制，同時(shí)也在全球范圍內(nèi)發(fā)揮越來越大的作用。例如，2003年SARS病毒的溯源分析，2011年中國新疆輸入性脊灰野病毒傳播的溯源分析中，在2014-2016年西非地區(qū)埃博拉病毒流行病傳播的溯源中，都得到了廣泛應(yīng)用。

在國家科技重大專項(xiàng)資助下，病毒病所牽頭建立了一整套基于新冠病毒基因組分型與聚集分析算法等的監(jiān)測(cè)、溯源技術(shù)體系，可用于病毒性傳染病的預(yù)警預(yù)測(cè)，應(yīng)用部門包括我國各級(jí)疾病預(yù)防控制中心，以及科研、醫(yī)院等系統(tǒng)，將極大地提高我國本土病毒性傳染病預(yù)防控制能力，為我國重大傳染病的防控和生物安全體系建設(shè)發(fā)揮重要作用。

轉(zhuǎn)戰(zhàn)半個(gè)中國的抗疫英雄團(tuán)隊(duì)

在北京家門口再出征

自2019年12月31日凌晨接到任務(wù)開始，中國疾病預(yù)防控制中心病毒病所科研團(tuán)隊(duì)跨越半個(gè)中國，從湖北武漢到黑龍江綏芬河、牡丹江、哈爾濱，再到吉林舒蘭，這支科研隊(duì)伍，持續(xù)奮戰(zhàn)數(shù)月，沖鋒在這場(chǎng)抗疫戰(zhàn)爭(zhēng)的最前沿。每到一地，他們都快速建起移動(dòng)生物安全實(shí)驗(yàn)室，快速進(jìn)入戰(zhàn)斗狀態(tài)。

北京新發(fā)地疫情暴發(fā)后，武桂珍研究員帶領(lǐng)團(tuán)隊(duì)在家門口再次出征，他們快速組成新型冠狀病毒感染溯源工作組，第一時(shí)間緊急來到新發(fā)地農(nóng)產(chǎn)品批發(fā)市場(chǎng)，在市場(chǎng)內(nèi)部進(jìn)行溯源調(diào)查和采集樣本，6月14至15日，兩天時(shí)間就采集了近千份樣本并立即進(jìn)行新型冠狀病毒核酸檢測(cè)。

據(jù)專報(bào)公布，疫情發(fā)生后，北京市迅速擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)能力，7000多名工作人員輪班上崗，2000多個(gè)采樣點(diǎn)位全負(fù)荷運(yùn)行。截至2020年6月22日，北京市具備核酸檢測(cè)能力的機(jī)構(gòu)已達(dá)128所。同時(shí)，國家衛(wèi)生健康委協(xié)調(diào)全國12個(gè)省20支核酸檢測(cè)隊(duì)支援北京，調(diào)配移動(dòng)P3實(shí)驗(yàn)室，動(dòng)員增加實(shí)驗(yàn)室建設(shè)，同時(shí)協(xié)調(diào)天津、河北分擔(dān)北京部分檢測(cè)任務(wù)，為北京應(yīng)檢盡檢提供了重要的支撐。

[責(zé)任編輯：楊凡、武云泉]

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